ГУСП является федеральным органом исполнительной власти (федеральным агентством), осуществляющим в пределах своей компетенции функции по обеспечению исполнения Президентом Российской Федерации полномочий в сфере мобилизационной подготовки и мобилизации в Российской Федерации.
Начальник ГУСПа имеет двух заместителей начальника Главного управления.
Полномочия, задачи и функции ГУСПа в установленной сфере деятельности определены «Вопросы Главного управления специальных программ Президента Российской Федерации».
